EvaGreen® foi projetado para minimizar a interação com o DNA em células vivas. Os resultados experimentais confirmam que não penetra nas luvas de látex ou nas membranas celulares. Não é citotóxico nem mutagênico, nem em concentrações bem acima das concentrações de trabalho usadas em qPCR. Além disso, EvaGreen® foi aprovado nos testes de segurança ambiental de acordo com o Título 22 CCR de Caracterização de Resíduos Perigosos, um regulamento ambiental do estado da Califórnia. Como resultado, o produto de coloração EvaGreen® não é apenas seguro para manusear, mas também pode ser convenientemente descartado no ralo.